Daugybę metų Užupyje gyveno žydų pirkliai. Užupio gale glaudėsi senosios žydų kapinės. Šiandien iš jų likęs tik monumentas.
Iki 1941 m. rajone veikusios sinagogos šešėlį galima pamatyti šiuolaikiniame gyvenamajame name.